Tại Diễn đàn "Vì ĐBCSL thịnh vượng và thích ứng với khí hậu", Thủ tướng Nguyễn Xuân Phúc đã chỉ ra các nguyên nhân khiến nền kinh tế của vùng đạt được kết quả chưa xứng với tiềm năng. Đó là: Thiếu sự liên kết một cách hiệu quả giữa các tỉnh; vẫn còn tình trạng tỉnh nào biết tỉnh đó, thiếu kế hoạch liên kết vùng để hỗ trợ nhau cùng phát triển. Việc kêu gọi đầu tư phát triển công nghiệp gặp khó khăn vì thiếu các điều kiện như xa nguồn năng lượng, suất đầu tư xây dựng lớn do xa nguồn cung cấp nguyên vật liệu; một số địa phương đã phát triển được ngành may mặc, da giày (ngành trước đây tập trung chủ yếu tại TP Hồ Chí Minh và các tỉnh lân cận), giải quyết được một phần lao động nhưng giá trị gia tăng thấp, các nhà đầu tư chủ yếu khai thác nhân công giá rẻ và hưởng các ưu đãi. Chưa có chiến lược phát triển công nghiệp phù hợp, tương xứng với thế mạnh của vùng ĐBSCL; ngành chế biến thủy hải sản tuy có nhiều tiến bộ nhưng vẫn thiếu những cách làm mới, hiện đại, sáng tạo, chưa biết cách tối ưu hóa chuỗi sản xuất.